农业厅级学术报告Resis的定量基因组学

1、记者:

丹尼尔·克莱本斯坦教授

二、报告单位:

加州大学戴维斯分校

3. 演讲者名称:

灰葡萄孢与真双子叶植物相互作用中抗性和毒力的定量基因组学

4、报到时间:

2017年4月21日(星期五)15:00-17:00

5、报到地点:

中国科学院微生物研究所A102

6、主持人:

叶健研究员

七、报告摘要:

宿主/病原体相互作用研究的分子和/或基因组研究依赖于使用引起流行病爆发的病原体的大效应模型。 这就开发了一种通用分子模型,其中宿主和病原体的蛋白质或代谢物的相互作用触发“免疫”反应以产生定性抵抗力。 目前尚不清楚这种触发的免疫模型如何应用于其他系统,例如广泛宿主范围的地方性定量病原体。 为了测试先天免疫模型如何应用于定量的地方性病原体,我们正在使用坏死营养型真菌病原体灰葡萄孢和一系列真双子叶宿主以及最近未被识别的单子叶植物宿主来研究宿主/病原体相互作用的分子基因组学基础。

对 96 个不同灰霉病菌分离株的基因组进行测序和 GWA 研究表明,病原体中没有主要效应位点,相反,病原体方面的定量毒力与拟南芥和其他双子叶植物(包括番茄、生菜、菊苣、向日葵)的定量抗性一样多基因。 、大豆和芸苔属。 许多新的成果将在演讲中呈现。

八、个人简介:

Daniel Kliebenstein 教授于 1999 年在康奈尔大学获得遗传学博士学位,现为马克斯·普朗克研究所的博士后研究员。 他目前是加州大学戴维斯分校的正教授和哥本哈根大学的 DG 客座教授。 他是The Plant Cell、eLife等多家国际知名期刊的编辑。

该实验室主要应用生化基因组学来研究两个主要问题。 第一个问题主要以拟南芥为材料,重点研究植物如何以及为何产生次生代谢产物,以及植物如何通过次生代谢产物控制与昆虫的相互作用。 和真菌相互作用。 第二个主要问题是生物体如何以及为何具有遗传变异,次生代谢物的表型分析也用于研究和开发一套方法学,以了解可应用于任何物种的定量遗传学和基因组学的基础。 实验室的研究成果发表在The Plant Cell、PLoS Genetics、eLife等期刊上。

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