芸豆畸形的原因有多种，主要包括以下几个方面：
一是药物敏感性问题。芸豆对某些药物如代森锰锌、代森锌或乙霉威类药物极为敏感，一旦使用过量，就可能导致荚果弯曲。此外，它还对杀毒矾和铜制剂等有强烈反应，轻则荚果弯曲，重则落叶落荚。
二是缺乏必需元素硼。硼对于促进芸豆坐荚至关重要，如果土壤中硼元素不足，不仅坐不住，也会导致花大荚长，但其形状变成弯曲，最终影响产品质量。解决方法是在喷施前用1200倍速乐硼溶液进行预处理。
三是环境温度不适宜。芸豆生长的理想温度范围在白天23℃~25℃、夜间18℃之间。如果环境温度低于20℃或高达30℃都可能干扰到坐荚过程。在热带时段特别要注意监控棚内温度，并采取措施调节棚温以保持最佳生长条件。
四是土壤湿度问题。大棚中的土壤如果太干或者水分过多，都容易造成刚刚形成的荚果出现弯曲。这通常与根系受伤有关，从而影响植物的整体健康和开花坐荚能力。因此，要根据土壤湿度情况合理浇水，以避免过度浇灌造成根部损害。
五是肥料和农药使用上的失误。一些菜农为了促进早产或防止落叶会使用过量的矮化剂、苯醛甲环唑等化学品，这些都会增加艺术小麦受到畸形因素影响的风险，如使其产生弯勾现象。此外，有时候防落 荚时萘乙酸浓度超标也会引起类似的问题，因此，在施用任何化学品时务必遵循说明书指示，不可滥用或超标发挥。
六最后，如果所用的肥料过多，或在盐碱地上栽培，还可能导致由于土壤溶液浓度升高而引起植物生长异常，如使其产生畸形。这可以通过减少化肥投入并采用腐殖酸类肥料来缓解，同时在盐碱地种植时应考虑无土栽培方式，以保护根系免受污染。
