1、立枯病：在高湿低温的4至5月季节，危害幼苗基部，严重时导致成片死亡。幼苗被害后，在假茎（叶柄）基部出现水渍状黄褐色条斑，这些斑点随着病情的发展变得更加暗褐色，最终导致幼苗折断死亡。预防方法包括用70%敌克松可湿性粉剂500至800倍液进行灌根和喷雾。
2、炭疽病：这是一种对叶、叶柄、茎和果实等多个部分造成损害的疾病。在假茎（叶柄）的基部，会出现梭形红褐色斑或长条形环绕凹陷缢缩斑，从而引起幼苗折断倒伏。而且，如果顶端发生坏死斑，那么会造成幼苗顶端枯萎。此外，还可能产生灰绿色的同心轮纹，然后变为褐色，上面覆盖粉红色或黑色的孢子堆，最终破裂穿孔。茎和叶柄也会受到影响，由于产生梭形黄褐色溃疡斑，致使它们盘曲并扭曲，以及干花干籽。此外，还可能诱发羊肠头（根茎芽）腐烂。果实上则出现圆形或不规则浅凹陷斑，并伴有果皮腐烂。防治措施包括使用50%多菌灵可湿性粉剂800至1000倍液以及75%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液等药剂。
3、根腐病：在6至8月雨季期间，这种疾病更容易发生，其危害程度与植物年限成正比。当侧根开始烂化并蔓延到主根时，将导致整个植株枯萎。这类症状从地上表现为非正常颜色的叶片下垂，最终导致全株死亡。在这种情况下，可以通过灌注58%瑞毒霉可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂300至500倍液来预防。
4、疫病：三七园内过密及高湿环境易促进疫疾传播，而干旱少雨后转凉时期是其发作轻度的一段时间。在初期，它们以暗绿色的不规则痣状出现在植物表面，如被开水烫过，但随着时间推移这些痣将变成软腐性的褐色区域甚至粘附在植物上。此外还可能影响到地下部分，如黄褐色的腐败地区。如果发现此类症状，可采取减少田间管理中温湿度水平，加强清除残体集中焚烧以及使用65%代森锌可湿性粉剂500倍液喷洒来治疗。
5、蚜虫：它主要危害于三七的茎和叶，使得植株矮小且生长受阻。一旦发现可以通过喷洒莫比朗1500倍液或者50%抗蚜威2000倍液来解决问题。
6、高产红蜘蛛群集于三七的背面吸食汁液，对植株造成皱缩和脱落最大风险是6-10月份。此外，他们还能破坏花盘和果实，使其萎缩并失去肥力。但要加强园区清洁工作，并且在3月底前开始每7天一次喷涂波美度石硫合剂；到了6-7月即使需要继续连续几次，以确保有效控制。而到了8-10月份，此类行为应尽量避免，以免进一步加剧问题。
7、蚧壳虫通常是在每年的六月开始活动，大雨之后从地面爬向植株；接着进入八九十个日历单位中最严重的一个阶段，它们越来越频繁地攻击新生枝条，小枝、小花轴等其他部分，被侵染后的植株迅速衰弱，小花也跟着早早谢世。不幸的是，一旦它们占据了适宜栖息的地方，即便是手动处理，也难以完全消除他们的问题。这时候，我们必须依赖40%-80%速效杀灭器如优乐得1000~2000PPT,及25%-35%优乐得20PPT等产品进行全面打击。
