猪流感病毒是一种重要的人畜共患病病原体。先前的研究发现，禽、猪和人甲型流感病毒可以共同感染猪，并创造新的人畜共患病或大流行的可能性，突出了猪在甲型流感病毒重组和进化中的关键作用。
近日中国研究人员发现新型猪流感病毒，香港大学公共卫生学院在EMERGING INFECTIOUS DISEASES发表题为“Natural Reassortment of Eurasian Avian-Like Swine H1N1 and Avian H9N2 Influenza Viruses in Pigs, China”的研究文章，发现H9N2禽流感病毒正在中国的猪中感染，并与猪流感病毒重组，这表明需要在中国和其他地方继续监测猪流感病毒。
重组猪流感病毒
在 2021 年 4 月至 202 年 2 月期间，共收集了 829 份猪鼻拭子样本，分离出 8 种甲型流感病毒：7 种来自 2021 年 8 月，1 种来自 2021 年 9 月。研究人员将这些序列与参考序列进行了比较，发现：
2021 年 8 月检测到的甲型流感病毒是 H3N2 病毒。这些病毒的血凝素和神经氨酸酶片段与人类 H3N2 猪甲型流感病毒有关；然而，它们的内部基因片段都来自大流行的 H1N1 A 病毒谱系。
猪 H1N1 IAV，A/swine/HK/NS419/2021，于 2021 年 9 月分离，是多个猪流感谱系之间的重组。该病毒的PB1和M基因片段属于禽H9N2病毒亚型，但该病毒含有源自pH1N1谱系的PB2、聚合酶酸和NP基因片段，其HA和NA基因片段属于欧亚禽H1N1谱系，及其非结构基因片段属于三重重配谱系。
进一步研究发现A/swine/HK/NS419/2021分离株具有SH/F/98样谱系的PB1基因片段和G1样H9N2谱系的M基因片段。值得注意的是，在人畜共患病病毒中也检测到了相似的PB1和M序列，在H10N8中检测到PB1，在H7N9中检测到M，但这两个片段中没有发现已知序列。哺乳动物宿主适应突变。该分离物的 PB1 和 M 基因片段编码的蛋白质具有在哺乳动物和鸟类 IAV 中很少观察到的氨基酸序列。
在人群中受欢迎？
2020年6月29日，中国农业大学兽医学院刘金华教授与中国疾控中心主任高福院士在国际权威期刊《Proceedings of the美国国家科学院”（PNAS）。2009年“大流行病毒基因促进人类感染”文章讨论了多种欧亚禽流感样H1N1猪流感重组，其中一个与本研究中分离的A/swine/HK/NS419/2021有相似之处，唯一的区别是PB1和M该病毒的基因片段属于 pH1N1 谱系。
上述文章发现，基因4型欧亚类禽流感A病毒可以与人唾液酸受体结合，使病毒在人气道上皮细胞中高效复制。血清学监测进一步表明，10% 的研究养猪工人对基因型 4 重组呈阳性。序列分析显示，上述文章报道的部分基因4型病毒与本研究分离的欧亚禽H1N1病毒可能有共同祖先中国研究人员发现新型猪流感病毒，提示该基因型及其重组流行潜力需要进一步风险评估。
此外，已发现与人类感染相关的甲型禽流感病毒含有源自禽H9N2病毒的内部基因，提示H9N2病毒的内部基因可能有助于人畜共患病的传播。在这篇文章中，研究人员在分离物中检测到猪甲型流感病毒和H9N2禽流感病毒的聚合酶碱性蛋白1和基质基因片段，提示该病毒株存在人畜共患传播的可能性。
总之，本研究从 H9N2 亚型中鉴定出一种具有聚合酶必需 1 和基质基因片段的欧亚禽 H1N1 猪流感病毒，表明 H9N2 病毒正在感染猪并且与中国的猪流感有关。病毒的重组表明需要在中国和其他地方继续监测猪流感病毒。
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