生物伦理问题
肉狗养殖引发了广泛的生物伦理争论。很多人认为，将动物视为商品来进行饲养和屠宰，背离了对生命尊重的基本原则。这种做法被批评是对动物权利的侵犯，因为它们无法表达自己的意愿，也不能理解自己将成为食物的事实。这一观点在公众心中形成了一种负面印象，对肉狗养殖产生了阻力。
食品安全风险
与传统畜牧业相比，肉狗养殖是一项较新的行业，其食品安全管理体系未得到充分完善。在没有严格标准和监管的情况下，肉狗可能会受到疾病或污染影响，从而导致食品安全问题，这对于消费者来说是一个巨大的担忧。此外，由于缺乏长期研究数据，我们无法完全保证这些食用犬类产品对人类健康是安全无害的。
市场需求不足
目前市场上已经有多种高质量且价格合理的蛋白质来源，如鸡、猪、牛等，因此人们对于新型替代品如食用犬类并不急切。除非能提供显著不同的营养价值或者更好的口感和风味，一般消费者不会主动选择尝试这种新鲜事物。而且，由于文化因素和饮食习惯的问题，大部分地区的人民倾向于坚持传统食品，不太愿意接受新颖的餐桌选择。
法律法规限制
不同国家和地区对于牲畜饲养业有一系列法律法规，但至今还未普遍适用于特殊动物如小型犬类。例如，在一些地方，小型犬类被视为宠物，而不是牲畜，因而存在法律上的界定模糊性。此外，还有关于环境保护、动物福利等方面的一些规定可能会限制甚至禁止某些类型的小型犬类作为食用对象。
经济成本高昂
从生产到销售过程中，无论是饲料还是加工技术，都需要额外投资以确保质量控制。这使得最终产品价格上升，使得它在市场竞争中的优势变得薄弱。此外，由于小型犬类通常具有较短寿命，它们需要快速成长才能达到销售年龄，这要求更频繁地投入资源进行补偿性喂配，以促进生长速度，同时也增加了成本支出。
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