芸豆畸形的原因多种多样，其中之一是芸豆对某些药物极为敏感，如代森锰锌、代森锌或乙霉威类药物过量使用，容易导致荚果弯曲。更有甚者，喷施含铜或炭疽福美等成分的剂劑，也可能引发药害，造成荚果畸形。除此之外，缺乏硼也会影响芸豆坐荚的问题，其解决方案在于在花前施用1200倍的速乐硼溶液。
此外，不当的温度控制也是一个关键因素。芸豆生长最适宜的温度范围是白天23至25摄氏度、夜间18摄氏度，如果环境中出现低于20摄氏度或者高达30摄氏度以上，都可能干扰植物坐荚过程。在花期期间，要密切监控棚内温度，并进行必要调整以保持合理温室条件。
土壤湿度问题同样不可忽视，大棚中的土壤如果过于干燥或者积水过多，都会损伤根系，从而影响开花和坐荚，最终导致荚果弯曲。这要求菜农要根据土壤墒情恰当浇水，不应大水漫灌，以免造成根部受伤。
另外，一些菜农在追求旺盛生长时，有时候会不慎使用过量化肥如矮壮素、苯醚甲环唑等，这些措施虽然能促进植物快速成长，但却可能导致艺术性产品——美味无瑕绿豆的一系列畸形问题。此外，对于防落荷效果显著但易引起副作用的萘乙酸，也需谨慎处理其浓度，以免再次给艺品带来不幸。
最后，当地土壤溶液浓度太高，由于施化肥过多或栽培盐碱地所致，这也是一条通往畸形之路。为了避免这种情况发生，可以采取少施化肥、大补腐殖酸类肥料策略。当荚果达到3至4厘米长度后，每亩地可增加15至30公斤腐殖酸类饲料来补充营养，同时注意减少化肥输入以避免进一步升高土壤溶液浓度。此法尤其适用于盐碱土地，即使是在无土栽培中亦需格外小心，因为直接接触盐碱地会严重损害根系健康。
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