三七作为国家扶持的种植项目之一，其在中药材生产中的重要性不言而喻。然而，这些宝贵的植物常遭受立枯病、炭疽病、根腐病、疫病以及多种害虫如蚜虫、红蜘蛛和蚧壳虫的侵扰。
立枯病通常在春季高湿低温时期爆发，主要影响幼苗基部，导致种子或芽部变黑褐色腐烂，幼苗折断死亡。防治方法包括使用70%敌克松可湿性粉剂500～800倍液进行灌根和喷雾处理。
炭疽病会感染叶片、叶柄、茎及花果等部分，使得幼苗出现梭形红褐色斑或长条形环绕凹陷缢缩斑，最终导致倒伏。其它症状包括灰绿色同心轮纹坏死斑，上生粉红色或黑色孢子堆，以及破裂穿孔。此类疾患可以通过50%多菌灵可湿性粉剂800―1000倍液等药剂来防治。
根腐病往往在雨季尤为严重，特别是对年限较长的植株造成更大影响。这场疾病从侧根开始蔓延至主根甚至整个茎基部，最终导致整株植物枯萎死亡。预防措施包括使用58%瑞毒霉可湿性粉剂300～500倍液进行灌溉治疗。
三七疫病通常与阴暗潮湿环境有关，在多雨季节容易发生。一旦发生，它们会以不规则形状的暗绿色斑点出现在叶片上，并逐渐软化下垂，最终可能导致全株死亡。为了控制这一问题，可以采取降低田间管理水平减少水分和温度，同时清除残体并集中焚烧，以及使用65%代森锌可湿性粉剂500倍液喷洒治疗。
蚜虫通过吸食植物汁液引起叶片皱缩，从而削弱植株生长。在这种情况下，可采用莫比朗1500倍液或50%抗蚜威2000倍液来喷洒于被害区域，以驱赶这些害虫。
红蜘蛛危机最为严重，一般在夏末秋初期间活动，它们群集于叶背吸取汁质使之变黄且脱落。此外，还可能直接损伤花盘和果实。为了应对此类威胁，可以定期清洁园地，并应用波美度石硫合剂，每隔7天进行一次每次两到三次喷洒；同时，在危害盛行时段（6-7月），使用5%尼索朗2000―4000倍液进行处理以保护三七作物免受侵袭。
最后，对付蚧壳虫需要注意观察它们在地面上的活动，并及时手动捏杀。如果发现有大量寄生的迹象，则需施用40%速扑杀1000―2000倍液或者25%优乐得1000―2000倍liquid进行有效治疗，以保障这份国家支持下的珍贵资源免受进一步破坏。
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