三七种植业的前景充满希望，而有效防治常见病虫害则是保障其良好生长的关键。以下是一些重要的病虫害及其防治措施：
立枯病：在4-5月高湿低温季节，幼苗基部遭受严重侵害，甚至导致种子、种芽发黑腐烂。早期症状表现为水渍状黄褐色条斑，在叶柄基部出现，随着时间推移深化成暗褐色，最终导致幼苗死亡。预防方法包括使用70%敌克松可湿性粉剂500-800倍液进行灌根喷雾。
炭疽病：这类疾病会影响三七植物的叶、叶柄、茎和果实，使之产生梭形红褐色斑或环绕凹陷缢缩斑，最终引起倒伏和顶部坏死。若在茎和叶柄上发生，则可能造成盘曲扭折，以及干花干籽。而对于果实被感染，将会形成浅凹陷斑并腐烂。在这种情况下，可以通过使用50%多菌灵可湿性粉剂800-1000倍液或者75%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液等药物进行治疗。
根腐病：在6至8月雨季期间，这种疾病尤为常见，其危害程度与植物年限成正比。一旦主根受到侵袭，它们将逐渐扩散到整个根系，引起地面部分萎蔫直至全株枯死。在这种情况下，可采用58%瑞毒霉可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂300-500倍液进行灌根处理，以减轻损伤。
疫病：通常出现在潮湿环境中，如荫棚密集或天气过于干旱少雨时，此类疾病更易爆发。初期症状为不规则形暗绿色的斑点，但最终可能导致软腐及脱落，并且对根茎也有潜在威胁以此来加强田间管理降低温度和濕度，并确保所有残体得到即时清除并集中焚烧。此外，还可以用65%代森锌可湿性粉剂500倍液进行喷洒以控制疫情发展。
蚜虫：这些小型昆虫通过吸取植物汁液使得植株变得矮小且健康状况恶化。这一问题可以通过使用莫比朗1500倍液或者抗蚜威2000倍油来解决它们对茎叶表面的危害。
红蜘蛛群聚于植物背面吸食汁 液，使其变黄、枯萎脱落；它们主要活动于6至10月份，对花盘及果实有特别大的影响。在这一阶段，一定要保持园区清洁，同时从3月底开始，每7天喷一次波美度石硫合剂，每次至少两到三次。如果到了盛行期，即六七月份，可采取更多措施，比如使用尼索朗2000―4000倍液每周一次，连续2～3次，以打击这群有害生物。
蚧壳虫一般开始于每年的六月，大量雨后从地面爬上植株危害；接着转移到7个月后的小枝以及8至10个月间更加严重。这时所做的任何努力都将徒劳，因为它们已经附着在了植株上的各处抽取汁料，不仅如此还会直接破坏新鲜花朵及未成熟的小果实，最终导致他们无效而丧失价值。但如果能发现早期迹象，即刻手动捏杀这些细小生物也许还有救。而当真正爆发的时候，就需要迅速采取行动，用40%速扑杀1000―2000倍水溶解物品或25%优乐得同样比例浓度油溶解物品喷雾涂抹，以消灭这些蚧壳虫幼体。此外，如果没有足够的手段去处理大量现存的问题，那么只剩下观察并记录三个步骤——观察当前的情况（识别）、制定计划（策略）以及实施计划（操作）。
