为了确保茄子种植的成功，首先要选择无病毒的优质种子。如果发现种子感染了病菌，可以采取以下几种处理方法：一是将种子浸入温水中进行消毒，通过预热水后再放入55℃或50℃温水中浸泡一定时间，然后迅速转移到冷水中冷却，最终晾干后再播下。二是使用40%福尔马林的300倍液对种子进行15分钟的浸泡，再彻底清洗后播下。三是混合50%苯菌灵和50%福美双粉剂与土壤相结合，按照每千克土壤添加0.1%这样的比例拌匀。
在准备苗床时，要对土壤进行消毒处理。如果使用的是旧苗床，可将50%多菌灵可湿性粉剂加入每平方米10克，与土混合，然后播下新植物，或使用50%福美双可湿性粉剂5克与10～15公斤细土拌匀，将其中的一部分药土撒在苗床上，一部分覆盖于表面。
加强栽培管理也是防治褐纹病的关键。在早期就要及时摘除感染了病害的叶片和果实，并在收获完毕之后彻底清理所有可能藏有疾病孢子的区域。当初期症状出现时，可以喷施含有50%扑海因或苯菌灵成分的高浓度液体，每隔7到10天防治一次，连续2到3次。此外，还可以根据实际情况调整防治方案，以达到最佳效果。
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