在辣椒出苗之后，管理其生长至关重要。首先，要注意浇水的频率和量，避免过度湿润，这样会导致根部腐烂和秧苗死亡。当土壤湿度较高时，可以通过撒上草木灰或细土来调节。浇水应根据土壤状况进行，即床土未发白之前不宜施水。此外，在晴朗的中午时分浇水，并采取适当的通风措施以防止病害。
为了控制浇水量，最好采用小水浇法，让植株完全吸收后再进行大水浇。大规模的灌溉后需至少晾干一天再次施用，以免造成根部缺氧。而且要确保在干燥后的第二天再次施肥，因为辣椒需要充足的营养才能健康成长。
由于湿度过高可能导致秧苗猝倒，因此在完毕后的晾晒过程中应覆盖薄膜以保护它们。在4片叶子出现后，定期给予适当的滋润，以促进根系发展并加速缓慢生长阶段。最佳的浇灌时间是早晨10点到下午1点之间，这段时间有利于植物吸收。
整个成熟期内，保持床土半潮至潮湿状态对于培育健康繁茂的是必要条件。不过，在种植前7到10天内停止喷洒，并让苗床处于休眠状态；而在最后一晚前，再一次彻底地浸透整个床面，为接下来移栽做准备。
此外，对于温度管理也十分关键，一般建议白天维持23-25摄氏度，而夜间则降至13-15摄氏度。这是一个逐渐减少温度的小范围波动，使得幼嫩植株能够逐步适应寒冷环境。如果遇到寒冷季节，还需特别注意保温工作，以及对极端气候（如雨雪）提供良好的通风系统。此外，大棚内部的小型拱顶或薄膜应该被打开，以增加光照并增强植物抵抗力随着植物继续生长，其耐受低温能力将不断提高，因此温度控制应该呈现一个缓慢下降趋势。
移栽过程中，要格外注意选择合适除草剂，不要选用残留期太久不易消散药剂，以免影响辣椒幼苗发根。如果你打算施用底肥，那么务必确保距离幼苗有一定的空间以防烧伤或者死掉。
最后，不可忽视周围环境中的害虫，如蚜虫和飞虱。一旦发现这些害虫，就可以使用吡虫啉等杀虫剂进行处理，以防止疾病传播。
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